A Universidade Eduardo Mondlane empenha-se em ser uma instituição de excelência no contexto da educação, da ciência, da cultura e da tecnologia, educando para a vida os profissionais que capacita e assumindo responsabilidades no processo de inovação e transferência de conhecimento e no desenvolvimento sustentado.

A Universidade Eduardo Mondlane pugna pela sua integração e afirmação na comunidade científica mundial e por ser agente e objecto de mudanças e transformações da sociedade.

Para cumprir esta missão, a UEM deve nortear-se pelos seguintes princípios e propósitos:

1. gestão eficiente num contexto de autonomia universitária;
2. prática democrática, respeitando a independência intelectual e a liberdade académica;
3. desenvolvimento, valorização e utilização racional dos seus recursos, tanto humanos como materiais;
4. adequação constante dos curricula aos avanços da ciência e da técnica e à realidade nacional e regional;
5. reflexo das necessidades e perspectivas nacionais e regionais de desenvolvimento nas actividades de investigação, extensão e ensino;
6. aumento do número de ingressos e das taxas de sucesso escolar e de graduação, através do desenvolvimento de novos métodos de ensino e de avaliação;
7. apoio e cooperação com outros níveis do Sistema Nacional de Educação;
8. garantia de equidade em todas as acções com respeito pela diversidade cultural, étnica, racial, religiosa e de género;
9. que a condição económica e social não constitua limitante ao acesso aos seus cursos;
10. promoção da educação cívica, ética e social;
11. promoção do espírito académico, crítico e científico, bem como do brio profissional;
12. intensificação da ligação e da cooperação com o sector produtivo nacional e com a comunidade;
13. fortalecimento e alargamento da cooperação regional e internacional.